跨省双层户口需向户籍地公安机关申请注销。分析：根据户籍管理规定，一个公民只能拥有一个常住户口。对于跨省双层户口的情况，需确定保留的户口后，向需注销户口的公安机关提交申请，并提供相关证明材料，如身份证、户口本、户籍迁移证明等。公安机关核实无误后，会依法办理注销手续。提醒：若出现户籍信息冲突、被要求提供双重户籍证明或面临法律纠纷时，表明问题较严重，应及时寻求专业律师或户籍管理部门的帮助。
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具体操作：从法律角度，针对跨省双层户口问题，在不同情况下可采取以下具体操作：1. 若确定保留户籍地为A地，需向A地公安机关申请出具户籍证明，明确个人户籍信息。2. 随后，向B地（需注销户口地）公安机关提交注销申请，附上A地出具的户籍证明、身份证、原户口本等证明材料。3. B地公安机关收到申请后，会进行核实调查，包括与A地公安机关沟通确认等。核实无误后，将依法办理注销手续，并出具注销证明。4. 注销完成后，应妥善保管注销证明，以备后续使用。同时，及时更新个人身份信息，确保户籍信息与实际情况一致。
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处理方式：从法律角度，处理跨省双层户口的常见方式包括：1. 向保留户口的公安机关申请出具户籍证明。2. 向需注销户口的公安机关提交注销申请及相关证明材料。3. 配合公安机关进行核实调查，确保注销手续合法合规。选择方式：根据个人实际情况和便利程度，选择向保留户口或需注销户口的公安机关提出申请。同时，考虑时间成本和手续复杂度，选择最合适的处理方式。