首先，需明确公司注销应按法定程序进行。若恶意注销，如虚假出资或抽逃出资，将面临《公司法》规定的罚款。其次，依据《公司法》，恶意注销可能导致严重法律后果，包括高额罚款及可能的刑事责任。未及时处理，将影响公司信誉及股东个人信用。
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公司注销需分情况处理。正常情况：按流程提交注销申请，办理相关手续。存在违规行为：先整改，如补缴出资、纠正违法行为，再申请注销。已产生法律后果：缴纳罚款、处理法律纠纷，完成后再申请注销。
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法律上，处理公司注销的常见方式包括：按流程申请注销、整改后注销或接受处罚后注销。若公司运营正常，可按流程申请注销；若存在违规行为，需先整改再注销；若已产生法律后果，需接受处罚后注销。选择方式时，应考量公司实际情况及可能面临的法律责任。